MCA-Indonesia menyelenggarakan kegiatan lintas proyek untuk mendukung pelaksanaan tiga proyek utama dari Program Compact. Kegiatan ini berfokus pada integrasi sosial dan gender, akuntabilitas sosial dan lingkungan serta pemantauan dan evaluasi terhadap implementasi dari masing-masing proyek.

Kegiatan lintas proyek merupakan bagian tak terpisahkan dari Program Compact yang didukung oleh tim khusus yang berkontribusi terhadap kesuksesannya.