MCA-Indonesia dalam pelaksanaan PKGBM bekerja sama dengan Kementerian Kesehatan dan program Generasi Sehat dan Cerdas (GSC) yang diselenggarakan Kementerian Desa, Pembangunan Daerah Tertinggal, dan Transmigrasi.

Kerja sama dengan GSC dilakukan dalam pelaksanaan Kegiatan Sisi Permintaan. Sementara kerja sama dengan Kementerian Kesehatan dilakukan dalam Kegiatan Sisi Suplai serta Kegiatan Komunikasi, Pengelolaan, dan Evaluasi.

Adapun skema mekanisme pelaksanaan PKGBM adalah sebagai berikut: